Microscope inversé est un microscope optique avec sa source lumineuse et son objectif de condenseur situé au-dessus de l'étape de l'échantillon, tandis que l'objectif est situé sous l'étape de l'échantillon. Cette configuration est opposée aux microscopes traditionnels (verticaux). La conception inversée facilite la gestion des échantillons de liquide et des échantillons plus épais, car la gravité maintient les échantillons en place sans glissement de couverture.